办公室（机关党办）  负责机关日常运转，承担党建、文秘、档案、信访、保密、政务公开、新闻宣传、督查、综合治理、财务、统计等工作；负责机关组织人事、机构编制、教育培训等工作；负责处理区委审计委员会办公室日常事务。

法规审理股  承担审计规范性文件和工作指南的起草工作，承担机关有关规范性文件的合法性审查工作，承担机关行政复议、行政应诉等工作；负责管理统一组织的审计项目计划,负责机关审计项目工作量的审核；审理有关审计业务事项的审计报告、审计意见书、审计决定，督促检查审计决定的落实，负责对重大违纪违法问题线索的移送协调；负责指导和监督内部审计工作。

财政审计股  组织审计国家及省、市、区有关重大政策措施贯彻落实情况；组织审计区级预算执行、决算草案和其他财政收支，乡（镇）人民政府预算执行、决算和其他财政收支，财政转移支付资金；组织审计区级预算收入执行、税收征管和社会保险费征收等情况；组织行政事业单位财政财务收支审计；组织审计区国有企业和区人民政府规定的区国有资本占控股或主导地位企业的资产、负债和损益以及财务收支。

农业农村股  组织审计农业农村、扶贫开发以及其他相关公共资金和建设项目；组织审计区人民政府相关部门管理和其他单位受区人民政府及其部门委托管理的社会保障基金、社会捐赠资金以及其他有关基金、资金的财务收支。

经济责任审计股  组织对区管党政主要领导干部、国有企事业单位主要领导人员的经济责任审计；组织开展领导干部自然资源资产离任（任中）审计；组织开展自然资源管理、污染防治和生态保护与修复情况审计；组织审计区国有金融机构和区人民政府规定的区国有资本占控股或主导地位金融机构的资产、负债和损益审计；承担区经济责任审计工作联席会议办公室有关工作。

固定资产投资审计股  组织审计政府投资、以政府投资为主的建设项目以及其他关系到国家利益和公共利益的重大公共工程项目；组织审计区驻外非经营性机构的财务收支情况以及国际组织和外国政府援助、贷款项目。